「阿波とん豚」は、徳島県が誇る高級ブランド豚で、特に肉質の良さにこだわって開発されました。猪が持つ優れた肉質に関連する遺伝子領域を豚に取り込んでいます。
一般に考えられる遺伝子改変動物（ジェネティック・モディファイド・アニマル）のような人為的な胚操作を行わず、通常の交配により子豚を生産します。
猪遺伝子を持つ個体と持たない個体が存在しますが、ＤＮＡマーカーを指標として目的とする猪遺伝子を持つ個体を種畜として選抜します。この作業を数世代繰り返すことで目的領域以外は豚という豚群が完成しました。
時間をかけ、猪の遺伝子を豚へと取り込み、新しい系統として「阿波とん豚」が誕生しました。